Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 TRIM60P19-201ENST00000452879 1462 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MPI-213ENST00000566377 2809 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 FADS1-211ENST00000536991 2701 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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