Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms