Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms