Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms