Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTPAP49638 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TTPAP49638 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms