Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMNB1P20700 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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