Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms