Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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