Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms