Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms