Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms