Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PSMD6Q15008 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PSMD6Q15008 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms