Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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SGCGQ13326 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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