Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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NME3Q13232 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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NME3Q13232 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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NME3Q13232 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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NME3Q13232 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NME3Q13232 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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