Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK2Q13002 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms