Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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