Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms