Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRGP23470 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRGP23470 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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