Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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