Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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NDUFS4O43181 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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NDUFS4O43181 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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NDUFS4O43181 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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NDUFS4O43181 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NDUFS4O43181 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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