Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms