Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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COPS7AQ9UBW8 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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COPS7AQ9UBW8 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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