Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
POLKQ9UBT6 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
POLKQ9UBT6 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms