Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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USP35Q9P2H5 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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USP35Q9P2H5 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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