Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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