Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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RNF17Q9BXT8 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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RNF17Q9BXT8 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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RNF17Q9BXT8 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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RNF17Q9BXT8 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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RNF17Q9BXT8 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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RNF17Q9BXT8 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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