Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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