Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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