Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SS18Q15532 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SS18Q15532 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SS18Q15532 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SS18Q15532 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SS18Q15532 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SS18Q15532 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SS18Q15532 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SS18Q15532 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SS18Q15532 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SS18Q15532 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SS18Q15532 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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