Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GAPVD1Q14C86 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
GAPVD1Q14C86 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms