Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms