Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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