Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PICALMQ13492 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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