Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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