Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CHAF1AQ13111 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CHAF1AQ13111 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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