Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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