Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 TMEM52B-203ENST00000381923 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MEF2C-229ENST00000627659 2393 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 NELL1-203ENST00000357134 3022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 NECAP1-201ENST00000339754 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC01304-204ENST00000454455 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 XIRP2-205ENST00000409605 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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