Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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