Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUSP1P28562 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms