Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRGP23470 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms