Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRCP08575 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRCP08575 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRCP08575 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRCP08575 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRCP08575 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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