Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TDRD12Q587J7 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TDRD12Q587J7 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms