Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms