Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP5B1Q2VPB7 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms