Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms