Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms