Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SP140Q13342 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms