Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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