Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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