Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms